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环保抓得越来越严，水产养殖也不可避免，其中养猪首当其冲，很多地区实施禁猪政策，对于环评不达标的养猪场进行了拆除。养猪场污染主要包括猪粪和污水。只要粪便能够得到无害化处理，就不会对周围的土壤、水和空气等造成污染。发酵床养猪已经实施了几十年，但对其实用价值众说纷纭，但对粪便处理确实有良好的效果。
铺设30-50厘米的稻壳、锯末等材料作为发酵床垫料，接种EM菌，猪的粪尿排在发酵床上就可以被微生物分解发酵，从而实现无排放、无污染、无异味，彻底解决规模化猪场的环境污染问题。劳动消耗主要是由于需要定期翻动物料，以提高发酵效果。为了提高发酵床的实用性，要做好冬季保温和夏季降温工作。此外，可以购买手推式旋耕机进行翻动。
脱水粪便的含水量一般在40%以下，可以直接堆放发酵。经过20至30天的完全发酵，可以作为有机肥料用于粮食作物、蔬菜、果树和草地。污水液需要排入沉淀池进行5至10天的沉淀和发酵，然后排入莲藕或其他水生植物池。粪便的 "水洗 "过程被改为 "干清粪"。猪舍采用干清粪技术，每周冲洗一次后干清粪，喷洒消毒一次，可减少90%～95%的粪尿废水。采用干式清粪技术，实现了粪尿分离，尿液通过排泄沟送出猪舍。
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养殖场粪便的处理方法较多，这里主要说下干燥处理、好氧堆肥、沼气发酵以及饲料利用。
1干燥处理。就是粪便脱水以方便使用，主要有自然干燥和高温快速干燥。自然干燥是利用阳光照晒畜禽粪便进行干燥处理；高温快速干燥则是通过干燥机进行人工干燥。我国常用滚筒式干燥机，能使鸡粪的含水量由70%~75%在短时间内下降至8%以下，但存在烘干机排出的臭气二次污染以及处理温度过高导致肥效较差等缺点。
2好氧堆肥。畜禽粪便中含有大量的有机物及丰富的氮、磷、钾等营养物质，根据粪便原料和辅料的特性，根据堆肥要求的碳氮比和水分含量，对粪便和辅料按一定比例混合，并对堆体中氧气和温度进行适当控制，使粪便快速发酵生产有机肥。这种方法处理粪便的优点在于产物臭气少，且较干燥，容易包装、施用，可作为土壤改良剂或有机肥料应用于农业生产。
3沼气发酵。根据畜禽粪便中有机物含量高的特点，在一定的水分、温度（35℃~55℃）和厌氧条件下，通过各类微生物的分解代谢，形成甲烷和二氧化碳等可燃性混合气体（沼气），同时杀灭粪水中大肠杆菌、蠕虫卵等。沼气是清洁能源，可作为燃料用于家庭生活，养殖场大量沼气也可进行发电并网；沼渣沼液中含有氮、磷等成分，可作为肥料用于农业生产、也可用于养鱼、作物浸种等，沼气发酵是我国目前使用较广泛的粪便处理方法之一。
4饲料利用。畜禽粪便含有大量未消化的粗蛋白、粗纤维、粗脂肪和矿物质等，其中氨基酸的组成也比较齐全、含量也较丰富，经过加工处理后，可杀死病原菌、提高蛋白质的消化率和代谢能、改善适口性，能成为较好的饲料资源。
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