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草鱼烂鳃病的症状多出现在鳃上，但因发病原因、时间和病灶的不同，具体发病部位、鳃丝颜色也有不同。所以防治时要细心观察，针对不同的病因正确用药。
1、发病时间。由粘细菌引起的烂鳃病，流行时间多在4～10月；由原生动物引起的烂鳃病，发病时间集中在7～9月；由中华鲺引起的烂鳃病，多发生在6～10月。
2、病灶部位。粘细菌引起的烂鳃病，病灶主要在天盖上，俗说“开天窗”，即鳃盖内的表皮被腐蚀成半透明的小窗；原生动物引起的烂鳃病，病灶主要在鳃瓣淤血，多黏液，鳃丝尖端往往腐烂成半月形；中华鲺引起的烂鳃病，病灶主要在鳃丝上，鳃丝末端肿大，并挂有蝇蛆。
3、鳃丝颜色。粘细菌和原生动物引起的烂鳃病，鳃丝均呈红色；中华鲺引起的烂鳃病，鳃丝呈白色。
4、对症用药。根据草鱼烂鳃病的发病原因，对症用药，粘细菌引起的烂鳃病，每亩用生石灰20～30千克或漂白粉1千克，全池泼洒；原生动物引起的烂鳃病，每亩用硫酸铜1.5千克和硫酸亚铁0.5千克，混合后全池泼洒；中华鲺引起的烂鳃病，可用晶体敌百虫兑水后全池泼洒，效果良好。
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