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（1）食物链中只有生产者和消费者，故图中的食物链为：．
（2）该生态系统的建立所依据的生态工程原理主要有物质循环再生原理、物种多样性原理、整体性原理．
（3）和普通的农业生态系统相比，“四位一体”生态系统具有更大的产出投入比的原因是废弃物及人畜粪便中的能量被多级利用（充分利用了废弃物中的能量）．
（4）这种生产模式对环境的污染小，因为生产一种产品时产生的有机废物，成为另一种产品的投入（原料）．
（5）这种种植方式的优点有：不破坏植被，有利于保持水土；有利于保留系统内的生物多样性，减少虫害爆发的危险；可以节省大量的劳动力等．
故答案为：
（1）
（2）物质循环再生原理、物种多样性原理、整体性原理
（3）废弃物及人畜粪便中的能量被多级利用（充分利用了废弃物中的能量）
（4）另一种产品的投入（原料）
（5）不破坏植被，有利于保持水土；有利于保留系统内的生物多样性，减少虫害爆发的危险；可以节省大量的劳动力等
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