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畜牧业主要污染源源有：对环境造成污染问题比较突出的是臭气、生产污水和畜禽粪便。
畜牧场臭气主要来自饲料蛋白质的代谢产物，以及粪便在一定环境下分解产生，也来自粪便或污水处理过程。较臭的物质来自氨气、含硫化合物以及碳水化合物的分解产物。臭气不仅影响人畜健康，对家畜的生产性能及产品品质也有影
畜牧业污水以规模化养猪场和奶牛场产生的数量最多，问题最为突出。污水的数量及性质因采用不同的栏舍结构、冲洗方式和地板结构、材料以及生产规模而异。
家畜的粪便是畜产废弃物中数量最多、危害最为严重的污染源。粪便是家畜的代谢产物，每天排出的粪尿量一般相当于体重的5~8%
。畜禽粪尿排泄量主要受环境生态因子、饲料质量、饮水量等影响。
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