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漂白粉主要用于清塘消毒和预防、治疗细菌性疾病病。清塘消毒时，一般施药量为180kg/公顷。使用漂白粉时，不管池塘大小，用药量多少，必须做到先用水充分溶解，然后立即进行全池均匀泼洒，才能发挥其极强的杀菌作用，能迅速杀死水体中的水生昆虫、害鱼及各种疾病病原体。防治蟹病时，一般用药18kg/公顷，加水溶解后全池泼洒。
在水产养殖中，生石灰是目前公认的最为理想的清塘剂。生石灰清塘，不仅能杀灭塘内细菌、藻类和寄生虫等敌害生物，还能改善池塘底质，提高池水的pH值，促进底质铵、磷酸和钾等营养盐向水中释放，其效果较漂白粉好，是值得推广的水产药物。另外，生石灰中含化学成分氧化钙，是虾、蟹类生产的营养要素。
漂白粉及含氯类消毒剂不能与生石灰同时使用，因漂白粉及含氯类消毒剂都是酸性，而生石灰是碱性，如果同时使用，会产生拮抗作用，从而抵消或减弱漂白粉及氯类消毒剂和生石灰的使用效果。
水产养殖常用消毒方法：
1、物理消毒法：即采用沉淀池过滤或沸石粉吸附，将养殖水体中的杂质和污染物去除，此方法不会对养殖环境造成二次污染，但其弱点是对于资源的浪费却是惊人的。
2、化学药物处理法：此方法是延续了几十年的传统养殖处理方法，即采用生石灰、漂白粉、絮凝剂、含氯或含溴消毒剂以及一些染料等有机或无机化合物来改善水质，这种方法是治标不治本的方法，只能在短期内产生效应，但其在改良水环境的同时，会对水产养殖动物产生不良影响，有些甚至会对环境与食品安全产生重大影响。
3、微生物调控法：即利用有益微生物在水体吸收氨氮、亚硝酸氮及硫化氢等，有效分解大分子有机物，同时抑制致病菌的大量繁殖，这是一种治本的环境处理方法，也是推行绿色养殖的最佳措施。
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