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水产养殖中的真菌感染造成的疾病最常见的是是水霉病、鳃霉病和鱼醉菌病；
水霉病一般是用孔雀石绿处理，但是因为孔雀石绿是高致癌的，所以不让使用，现在只有使用硫醚沙星，有一定的治疗效果。鳃霉病就是用硫醚沙星，效果还可以。鱼醉菌病目前无药可治。
至于其他的几种真菌病，如链壶菌病、离壶菌病、海壶菌病都是无药可治的。
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