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在蛏子生产上，蛏子会发生大批死亡，其速度和规模是相当惊人的。从发现少量死亡到大批死亡只要几天时间。蛏子的突然大批死亡有其季节性和区域性，并与气候条件密切有关。从时间上看，大都发生在6月中旬到10月份，以小潮汛期间较多。从区域来看，死亡区的潮位较高，蛏子的密度也比较大，蛏子的大批死亡通常发生在天气闷热、高温、多雨或大风浪后。
造成蛏子大批死亡的原因，各地不尽相同，各有主次，而且往往是多方面综合作用的结果。主要有以下几个方面：
1、密度大、个体瘦弱是导致蛏子死亡的前因。蛏子大批死亡往往发生在繁殖高峰过后的高密度区，密度高，容易产生饵料缺乏；繁殖期后，蛏子体质虚弱，移动及潜居都发生困难，容易浮头，直至死亡。
2、多雨、高温、低气压、刮大风是产生蛏子大批死亡的重要气象因素，蛏子大批死亡往往多发生在：连续4天以上阴雨；小潮汛有1天以上日降雨量大于300毫米；日最高气温连续3天以上大于30℃；日气压持续3天以上小于1001毫巴；起水至大潮汛期间出现大于八级大风，将蛏子打出滩面，聚积成堆而引起死亡。
3、蛏子死亡后的污染及其相互感染也是引起蛏子大批死亡的原因。高温期蛏子死后腐败很快，污染底质，导致周围的蛏子相继死亡。
4、寄生虫病引起蛏子软体部消瘦、发红、繁殖期性腺不发育，当环境条件恶化时即“浮头”死亡。
5、养殖潮位高或者滩面不平，容易受高温和淡水等因子的不良影响。
6、苗种采捕和放养时温度过高、密度过大、贮运时间太长以及贝体损伤等多方面因素使移养蛏子的大批死亡。
7、海区发生赤潮，则是造成蛏子大批死亡的另一重要原因。
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