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河豚的疾病种类较多，有的疾病造成河豚死亡，给河豚渔业带来严重的经济损失。河豚疾病的发生很大程度上是由于饲养管理不善、水质差和没有防病措施所致。因此，必须采取一些有效措施预防疾病的发生。
1.加强日常的管理。养殖池应有专人管理，做好记录，每天早晚要巡塘1次。鱼病流行季节、阴闷恶劣天气和暴雨更要勤于巡塘，勤换水，保证溶氧量足，水质清新。
2.饲料搭配科学，投喂新鲜优质饲料做到“四定”，即定质、定量、定时、定位。不喂腐烂变质的饵料，及时清除残饵，改善水环境。
3.拉网、运输、催熟、催卵、转池时操作必须仔细，防止损伤鱼体，导致感染病菌而引起疾病。
4.搞好消毒和传染病的预防。池塘使用前应将池壁、池底彻底清洗干净，并用生石灰、漂白粉等清塘、消毒。食台每天消毒，经常暴晒，食台附近定期用漂白粉泼洒消毒。健壮鱼种或多或少带有某些病原体，投放鱼种苗需用药液对鱼体进行浸洗消毒。使用消毒药液时要随配随用，可用木盆或搪瓷碗配制，不宜用金属器皿配制药液。用药剂量要准确，保证鱼的安全。用药液对鱼消毒时要仔细观察，发现有异常情况立即停止用药，立即将鱼捞出移到另外的水池养治以防中毒死亡。
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