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中黄13和威廉姆斯82基因组的基因组序列比较
大豆是最重要的作物之一，占世界油籽产量的一半以上，占世界食用和动物饲料蛋白质的四分之一以上。 研究表明，栽培大豆约5000年前在中国驯化，并在全球传播。 大豆在引种和传播过程中遇到了严重的遗传瓶颈，来自不同地理区域的大豆品质可能表现出较高的遗传多样性。 目前的大豆参考基因组由威廉姆斯82个品种测序，这是在美国驯化的品种。 亚洲是最大的大豆种植和消费地区之一，其大豆生产对世界粮食安全至关重要。 高质量的参考基因组对物种功能分析很重要。 因此，有必要从亚洲大豆中组装新的优质大豆基因组，促进亚洲大豆功能基因组学研究和精英品种改良。
中国科学院遗传与发育生物学研究所、中国科学技术大学、江苏省农业科学院和Berry Genomics公司的生物学家通过单分子实时SMRT、高通量染色体构象捕获技术Hi-C和光学图谱数据，成功构建了中国大豆“中黄13”的新大豆基因组。
参与这项研究的Yanting Shen博士说：“我们最终组装的基因组是1.025 Gb。 其重复组N50为3.46 Mb，支架N50为51.87 Mb。 据我们所知，这是迄今为止报道的第四个连续植物基因组。 与以前常用的大豆参考基因组相比，我们新组装的基因组质量得到了很大的改善，它有更长的总序列长度，有更高的重复群N50和支架N50，以及更少的缺口”。 此外，经过仔细比较中黄13与威廉姆斯82之间的基因组序列，研究小组发现中黄13基因组出现大量遗传变异，有1404个易位、161个易位、1233个易位和易位、505506个插入缺失(505506 )
综合分析，在新基因组中注释36429个转座子和52051个蛋白质编码基因。
这项工作是来自各个领域科学家的伟大合作努力。 例如，为了使新的基因组注释更加准确和信息丰富，研究人员求助于转换元素研究专家杜建昌博士。
研究人员希望这个新的基因组能促进豆科植物基因组学研究和未来大豆作物的改良。
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