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1、运输前鱼苗的处理由海区捕来的鱼苗，要经过筛选，除去鱼体瘦弱和受伤的鱼苗，因为受伤的鱼苗容易感染细菌引起皮肤发炎红肿，或发生水霉病，患病后会很快蔓延，造成大量死亡。起运以前，要吊养2-3天，使鱼苗受到锻炼和排泄掉粪便，减少运输中水质的污染。
2、掌握好运输用水装运鱼苗的用水应与吊养池水的盐度相接近，运输途中加水也要保持盐度相对稳定。
3、装运密度海水鱼苗的耗氧量比淡水鱼苗高，故装运密度要少一些。一般一个350公斤容积的大木桶，可装体长1.5厘米的幼苗5-6万尾，或2.5厘米的幼苗3-4万尾。
4、增氧增氧是运输途中的重要环节，可采用人工击水和空气压缩机增氧补充相结合的方法，采用这种方法，经过12-16 小时的运输，成活率可达90%左右。
5、运输到达目的地后的处理鱼苗运抵后在下池之前，要调好水温、盐度，不能与运输用水相差太大。鱼苗卸下后先稍稍清洗，在池中吊养，让鱼苗休息1-2小时，再清理死鱼和污物，然后点数移往放养池。
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